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近3300種動物的基因組已被測序 動物全物種基因組測序“顧此失彼”

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日期:2021-12-08 16:45:46    來源:中國科學(xué)報    

近日,美國華盛頓州立大學(xué)領(lǐng)導(dǎo)的一項研究發(fā)現(xiàn),目前對動物基因組進行的測序多數(shù)集中在與人類相似的動物上。研究人員警告稱,這會使人們忽視生物多樣性和錯失機會。相關(guān)成果發(fā)表于美國《國家科學(xué)院院刊》。

研究人員分析發(fā)現(xiàn),近3300種動物的基因組已被測序。然而,與世界上166萬種動物物種相比,這一數(shù)字還是很少,脊椎動物在目前的序列中占了絕大部分。數(shù)據(jù)顯示,盡管脊椎動物只代表了3.9%的動物物種,但卻占測序數(shù)據(jù)集的54%。相比之下,代表78.5%物種的節(jié)肢動物門無脊椎動物,只占當(dāng)前數(shù)據(jù)集的34%。

“隨著基因組數(shù)據(jù)集的迅速積累,我們會發(fā)現(xiàn),目前數(shù)據(jù)集并不是均勻分布在動物生命樹中。”研究作者、華盛頓州立大學(xué)博士后研究員Scott Hotaling認為,無脊椎動物仍然非常缺乏相關(guān)研究,因為人們似乎更關(guān)心脊椎動物。

研究通訊作者、美國楊百翰大學(xué)助理教授Paul Frandsen表示,要了解整個生態(tài)系統(tǒng),必須對更多的生物進行采樣。脊椎動物是生態(tài)系統(tǒng)的重要組成部分,但昆蟲和許多其他小型生物可能發(fā)揮著更重要的作用,因為它們處于食物鏈的底端。

研究作者、華盛頓州立大學(xué)副教授Joanna Kelley還指出,目前絕大多數(shù)基因測序工作在發(fā)達國家開展,且大多數(shù)國家位于北半球,不同地區(qū)的測序工作也有特定的傾向。例如,北美國家對哺乳動物和昆蟲進行了較多測序,歐洲國家、亞洲國家分別對魚類和鳥類進行了較多測序。

近年來,幾項大型的基因組測序工作啟動,其中包括地球生物基因組計劃。該計劃設(shè)定了一個雄心勃勃的目標(biāo),在未來10年內(nèi)對所有真核生物進行測序。

截至2021年6月,該計劃已收集到3300多個動物基因組數(shù)據(jù)集。研究人員通過計算發(fā)現(xiàn),以目前每天大約測序4個基因組的速度,要到3130年才能實現(xiàn)對所有真核生物進行測序的目標(biāo)。

研究人員同時提出,促進該目標(biāo)實現(xiàn)的一個方法是發(fā)展基礎(chǔ)設(shè)施,并讓更多來自南半球的國家,尤其是動物多樣性豐富的熱帶地區(qū)的研究人員參與其中。(辛雨)

關(guān)鍵詞: 動物全物種基因組測序 動物基因組 脊椎動物 節(jié)肢動物

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